Contiene investigaciones canónicas sobre la actuación de distintos sacerdotes en sus parroquias, solicitudes de párrocos, solicitudes de vecinos de diversas poblaciones del país, asuntos matrimoniales, la investigación de un matrimonio clandestino (1898, expediente 40), legitimaciones de hijos y otros asuntos.

Cabe destacar los siguientes expedientes y asuntos tratados:

• Tercera Orden de Nuestra Señora del Carmen: Actas de la Tercera Orden de San José (1863, expediente 5) y memorial de la de Heredia (1898, expediente 17).
• Contribuciones vecinales para pagar un coadjutor en San Pablo de Heredia (1896, expediente 6) y en Sarchí (1898, expediente 26).
• Edificación de la Iglesia de La Merced de San José: Función benéfica en el Teatro Nacional (1898, expediente 9), certificación de resolución de la junta edificadora (1898, expediente 56).
• Junta edificadora del templo parroquial de Heredia (1898, expediente 10).
• Solicitud de los vecinos de San Pablo de Puriscal, parroquia de San Mateo, de agregación a la parroquia de Santiago de Puriscal (1898, expediente 14).
• Solicitud de erección de parroquia por los vecinos de Zapote (1898, expediente 18) y por los vecinos de San Ignacio de la Candelaria (1898, expediente 52). Este último expediente incluye listas de vecinos de las poblaciones aledañas y un informe del producto de primicias de la Parroquia de Aserrí.
• Erección de la parroquia de San Joaquín de Heredia (expediente 19).
• Petición de la Sociedad de Señoras de San Vicente de Paul en Guadalupe (1898, expediente 21); solicitud de la misma sociedad en Cañas (1898, expediente 49).
• Queja de los vecinos de Buenos Aires, Boruca y Térraba por la conducta del cura José Victoriano Mayorga y su disputa con Henry Pittier (1898, expedientes 22 y 23).
• Solicitud de los vecinos de Aserrí de conservar su párroco José G. Añibarro. Incluye lista de vecinos (1898, expediente 29).
• Solicitud de los vecinos de San Pedro de la Unión, jurisdicción de Grecia, para ser agregados a la coadjutoría de Sarchí (1898, expediente 34).
• Junta edificadora de Guadalupe (1898, expediente 35).
• Incorporación a la diócesis de San José de Costa Rica, para continuar sus estudios sacerdotales, de los presbíteros Francisco Göke (1896-1898, expediente 38) y Luis Leipold (1895-1898, expediente 39). Ambos expedientes incluyen cartas de presentación de Pedro Schumacher, obispo de Portoviejo, así como el curriculum vitae de Francisco Göke.
• Expedientes matrimoniales de Leopoldo Amador y Rosa Escalante Orias (1898, expediente 42) y de Leopoldo Solano y María Valenciano (1898, expediente 44).
• Solicitud de los vecinos de Santo Domingo de Heredia para que se les deje al coadjutor Juan Vicente Quirós (1898, expediente 46).
• Nombramiento de junta edificadora de la ermita del distrito de San Pedro, en Santa Bárbara de Heredia (1898, expediente 47).
• Expediente sobre el traslado de la imagen de Nuestra Señora de la Soledad de la Catedral de San José al templo de la Soledad (1898, expediente 55).

Contiene expedientes matrimoniales aprobados por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, con ocasión de sus visitas pastorales a diversas zonas del país en los años 1881 y 1882, concretamente a Portalón (folios 57-62), Cahuita (fol. 63), Juan Viñas (fs. 97-103), Tabarcia (fs. 104-105) y a diferentes puntos de la parroquia de Aserrí (fs. 186-196), así como remitidos a Monseñor Thiel para su aprobación durante su destierro en Panamá (fs. 197-204, 215-221, 223-234, 249-258 y 277-278).

Contiene además documentos muy diversos, en general relacionados con las visitas pastorales de Monseñor Thiel (nota sobre matrimonio celebrado por Monseñor Thiel en Portalón y notas de su visita a Boruca en 1881, fs. 64-65; información de diciembre de ese mismo año levantada por el canónigo Francisco Calvo sobre la difusión de ideas irreligiosas por el maestro de escuela de Aserrí, fs. 89-96; bautismos y matrimonios celebrados en Talamanca en 1882, fs. 106-109; borrador de carta de Mons. Thiel al gobernador de Limón sobre su visita pastoral a La Estrella en 1882, fs. 110-111; borrador incompleto de una crónica de una visita pastoral a Limón y Talamanca, fs. 114-119; e informe del estado moral y material de la Parroquia de Heredia junto con los inventarios de bienes y archivo de la parroquia y filiales con ocasión de su visita en 1882, fs. 124-179 ) o remitida al mismo durante su estancia en Panamá (solicitudes diversas, absoluciones de sacerdotes, letras dimisorias de Juan Trejos para su ordenación sacerdotal, fs. 247-248, y especialmente la información levantada por Monseñor Thiel en los meses de julio y agosto de 1885 relativa a la expulsión de los religiosos de la Congregación de la Misión que regentaban el Seminario de San José, fs. 1-39, y el expediente promovido por Monseñor Thiel en 1885 por indicación de la Santa Sede para la provisión de la sede arzobispal de Guatemala en fs. 236-245).

Contiene además algunos documentos anteriores al episcopado de Monseñor Thiel, especialmente una copia de las actas de la visita pastoral realizada en 1872 a Cartago y diversos lugares de la provincia (fs. 120-123).

Correspondencia, solicitudes y expedientes tramitados en la Curia diocesana a lo largo del año 1895 sobre diversos asuntos.

Cabe destacar las denuncias presentadas por Henry Pittier contra Monseñor Juan Pablo Salazar por su actuación como sacerdote en San Francisco de Guadalupe (folios 2-7), demandas de esponsales y otros asuntos de tipo matrimonial, solicitudes de vecinos, el compromiso de los vecinos de Térraba, Boruca y Santo Domingo de Golfo Dulce de construir el templo y realizar otras obras de mejoramiento de sus respectivas localidades (fs. 140-147), las letras dimisorias a favor del presbítero Francisco Gutiérrez y el expediente de órdenes sacerdotales del presbítero Andrés Vilá y Albó, que incluye una certificación de 1904 de documentos académicos presentados por dicho Vilá (223-249).