Contiene investigaciones canónicas sobre la actuación de distintos sacerdotes en sus parroquias, solicitudes de párrocos, solicitudes de vecinos de diversas poblaciones del país, asuntos matrimoniales, la investigación de un matrimonio clandestino (1898, expediente 40), legitimaciones de hijos y otros asuntos.

Cabe destacar los siguientes expedientes y asuntos tratados:

• Tercera Orden de Nuestra Señora del Carmen: Actas de la Tercera Orden de San José (1863, expediente 5) y memorial de la de Heredia (1898, expediente 17).
• Contribuciones vecinales para pagar un coadjutor en San Pablo de Heredia (1896, expediente 6) y en Sarchí (1898, expediente 26).
• Edificación de la Iglesia de La Merced de San José: Función benéfica en el Teatro Nacional (1898, expediente 9), certificación de resolución de la junta edificadora (1898, expediente 56).
• Junta edificadora del templo parroquial de Heredia (1898, expediente 10).
• Solicitud de los vecinos de San Pablo de Puriscal, parroquia de San Mateo, de agregación a la parroquia de Santiago de Puriscal (1898, expediente 14).
• Solicitud de erección de parroquia por los vecinos de Zapote (1898, expediente 18) y por los vecinos de San Ignacio de la Candelaria (1898, expediente 52). Este último expediente incluye listas de vecinos de las poblaciones aledañas y un informe del producto de primicias de la Parroquia de Aserrí.
• Erección de la parroquia de San Joaquín de Heredia (expediente 19).
• Petición de la Sociedad de Señoras de San Vicente de Paul en Guadalupe (1898, expediente 21); solicitud de la misma sociedad en Cañas (1898, expediente 49).
• Queja de los vecinos de Buenos Aires, Boruca y Térraba por la conducta del cura José Victoriano Mayorga y su disputa con Henry Pittier (1898, expedientes 22 y 23).
• Solicitud de los vecinos de Aserrí de conservar su párroco José G. Añibarro. Incluye lista de vecinos (1898, expediente 29).
• Solicitud de los vecinos de San Pedro de la Unión, jurisdicción de Grecia, para ser agregados a la coadjutoría de Sarchí (1898, expediente 34).
• Junta edificadora de Guadalupe (1898, expediente 35).
• Incorporación a la diócesis de San José de Costa Rica, para continuar sus estudios sacerdotales, de los presbíteros Francisco Göke (1896-1898, expediente 38) y Luis Leipold (1895-1898, expediente 39). Ambos expedientes incluyen cartas de presentación de Pedro Schumacher, obispo de Portoviejo, así como el curriculum vitae de Francisco Göke.
• Expedientes matrimoniales de Leopoldo Amador y Rosa Escalante Orias (1898, expediente 42) y de Leopoldo Solano y María Valenciano (1898, expediente 44).
• Solicitud de los vecinos de Santo Domingo de Heredia para que se les deje al coadjutor Juan Vicente Quirós (1898, expediente 46).
• Nombramiento de junta edificadora de la ermita del distrito de San Pedro, en Santa Bárbara de Heredia (1898, expediente 47).
• Expediente sobre el traslado de la imagen de Nuestra Señora de la Soledad de la Catedral de San José al templo de la Soledad (1898, expediente 55).

Contiene expedientes matrimoniales enviados por las parroquias de la diócesis a la Curia eclesiástica para su resolución, correspondencia de la curia con parroquias, autoridades civiles y particulares, junto con juicios de divorcio y otros documentos.

Cabe destacar los inventarios de bienes y archivos de las iglesias de Tucurrique y Turrialba (fs. 88-89) y de la Parroquia de Santa Cruz de Guanacaste (fs. 281-283), dos juicios de esponsales (fs. 105-140 y 384-396) y un juicio de nulidad (fs. 262-268), informe de la Parroquia de La Unión sobre matrimonios separados (fs. 151-152) y asientos de matrimonios efectuados en el pueblo de Terbi (Golfo Dulce) por el Cura interino de Boruca, Rafael B. Chinchilla entre el 20 de julio y el 10 de agosto de 1870 (fs. 275-276).

Predomina 1870.

Contiene documentación muy variada referente a los episcopados de Mons. Bernardo Augusto Thiel y Juan Gaspar Stork, segundo y tercer obispos de San José respectivamente, destacando:

• Borrador de alocución dirigida al clero el primer día del sínodo diocesano (fs. 1-15), más un decreto de Mons. Thiel relativo al mismo ("Modus vivendi", fol. 16).

• Planos, cotizaciones, facturas, cuentas, correspondencia relativos a la construcción de diversos templos y edificios de la diócesis de San José, especialmente el antiguo palacio episcopal, la catedral de San José y el templo de Limón (fs. 17 a 52).

• Expediente matrimonial de Boruca del año 1907 (fs. 55A-56).

• Consideraciones históricas firmadas por Manuel J. Jiménez, relativas a la aparición de la Virgen de los Ángeles (incompleto, fs. 58-59).

• Estadísticas de población de Costa Rica a 31 de diciembre de 1904 según la Dirección General de Estadística (fs. 60-75).

• Cuentas de la herencia del presbítero Raimundo Mora (fs. 87-103).

• Anotaciones relativas al Código de Derecho Canónico de 1917 (fs. 113-144).

Correspondencia de parroquias dirigida a Mons. Bernardo A. Thiel, II Obispo de San José, y a la curia diocesana, correspondiente a los meses de enero a junio de 1881, ordenada cronológicamente por meses, relativa a nombramientos, administración parroquial, tramitación de matrimonios y otros asuntos.

Incluye además alguna carta de autoridades civiles y particulares.

Cabe destacar las referencias a las visitas pastorales de Thiel, así como de algunos sacerdotes a Térraba y Boruca (fs. 5-6 y 31-32) y a Sarapiquí (fs. 23 y 234), a la construcción de la iglesia de Limón (fs. 110 y 216), a la publicación "El Correo Español" (fs. 169-170 y 227) y a la ermita de San Francisco de Asís en Guadalupe (fol. 308) y el informe sobre los límites entre las parroquias de San Vicente de Moravia y San Isidro de Coronado (fol. 273).

Incluye además copia del testamento de Maurilio Alvarado y carta de Marie Barthélemy de Sión a Mons. Thiel (fs. 206-207).

Contiene expedientes matrimoniales aprobados por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, con ocasión de sus visitas pastorales a diversas zonas del país en los años 1881 y 1882, concretamente a Portalón (folios 57-62), Cahuita (fol. 63), Juan Viñas (fs. 97-103), Tabarcia (fs. 104-105) y a diferentes puntos de la parroquia de Aserrí (fs. 186-196), así como remitidos a Monseñor Thiel para su aprobación durante su destierro en Panamá (fs. 197-204, 215-221, 223-234, 249-258 y 277-278).

Contiene además documentos muy diversos, en general relacionados con las visitas pastorales de Monseñor Thiel (nota sobre matrimonio celebrado por Monseñor Thiel en Portalón y notas de su visita a Boruca en 1881, fs. 64-65; información de diciembre de ese mismo año levantada por el canónigo Francisco Calvo sobre la difusión de ideas irreligiosas por el maestro de escuela de Aserrí, fs. 89-96; bautismos y matrimonios celebrados en Talamanca en 1882, fs. 106-109; borrador de carta de Mons. Thiel al gobernador de Limón sobre su visita pastoral a La Estrella en 1882, fs. 110-111; borrador incompleto de una crónica de una visita pastoral a Limón y Talamanca, fs. 114-119; e informe del estado moral y material de la Parroquia de Heredia junto con los inventarios de bienes y archivo de la parroquia y filiales con ocasión de su visita en 1882, fs. 124-179 ) o remitida al mismo durante su estancia en Panamá (solicitudes diversas, absoluciones de sacerdotes, letras dimisorias de Juan Trejos para su ordenación sacerdotal, fs. 247-248, y especialmente la información levantada por Monseñor Thiel en los meses de julio y agosto de 1885 relativa a la expulsión de los religiosos de la Congregación de la Misión que regentaban el Seminario de San José, fs. 1-39, y el expediente promovido por Monseñor Thiel en 1885 por indicación de la Santa Sede para la provisión de la sede arzobispal de Guatemala en fs. 236-245).

Contiene además algunos documentos anteriores al episcopado de Monseñor Thiel, especialmente una copia de las actas de la visita pastoral realizada en 1872 a Cartago y diversos lugares de la provincia (fs. 120-123).

Contiene documentos de diversa índole, especialmente:

• Inventarios de bienes y en ocasiones de archivos de distintas parroquias de la diócesis de San José de los años 1888, 1891 y 1892 (folios 1-30, 66-71 y 109-113);
• Correspondencia recibida por por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, y por sus colaboradores de la Curia diocesana durante el año 1891;
• Dispensas y expedientes matrimoniales tramitados en la Curia diocesana durante 1890 y 1891;
• Expedientes de solicitudes diversas dirigidas a la Curia;
• Confirmaciones hechas en Limón el 22 de septiembre de 1882 (fs. 188-189);
  -Contrato de compraventa entre Luis Machado, natural de china, y el presbítero José Victoriano Mayorga de un solar en Matina (1888, fol. 190);
• Bautismos, matrimonios y expedientes matrimoniales realizados en 1888 en la comarca de Limón por el presbítero José Victoriano Mayorga (fs. 191-210);
• Informe de la visita practicada en la Parroquia de Bagaces por el presbítero Januario Quesada en 1888, junto con un inventario de la parroquia y tres expedientes matrimoniales (fs. 211-225);
• Informe de la misión realizada a la comarca de Limón en 1888 (fs. 226-227);
• Listas de imposiciones de escapularios y expedientes matrimoniales de Golfo Dulce (1890, fs. 228-240);
• Informe de la visita realizada a Boruca, Térraba, Buenos Aires, Golfo Dulce y Savegre por el presbítero José Badilla en 1891, junto con bautismos, matrimonios, defunciones, expedientes matrimoniales e informaciones de cristiandad y defunción de esos lugares (fs. 241-284);
• Expedientes de legitimación de hijos (1891, fs. 286-291);
• Solicitudes de Juan de Dios Ortiz, juez de paz de San Francisco de Térraba (1891, fs. 292-295);
• Acta de la junta edificadora de la iglesia de Golfo Dulce (fs. 298-300).

Expedientes tramitados en la Curia diocesana, junto con correspondencia, informes y solicitudes recibidos por ésta de temática muy variada, procedentes del clero principalmente y en menor medida de particulares y grupos de vecinos.

Incluye informaciones sobre matrimonios clandestinos (folios 1-11); demandas de esponsales (fs. 210-211 y 365-372); informaciones seguidas por la Curia diocesana sobre la conducta de distintos sacerdotes (fs. 244-257); renuncias a parroquias; licencias sacerdotales concedidas a favor de Bruno Pereira en 1876 y renovadas sucesivamente hasta 1889 (fs. 349-354); retractación de varios sacerdotes a la declaración firmada el 10 de octubre de 1884 con motivo de la expulsión de Monseñor Thiel del país (fs. 234-243); cuentas de la Parroquia de Cartago correspondientes a 1889 (fs. 215-227); inventarios de bienes y archivos correspondientes a los años 1893-1894 de las parroquias de Bagaces (fs. 14-15), Esparza (fs. 114-115), Limón (fs. 258-260) y Puntarenas (fs. 319-320); circular de la Curia diocesana de 13 de diciembre de 1892 y contestaciones de distintos párrocos sobre el envío al Registro Civil de las listas de bautismos y matrimonios (fs. 20-36); contestaciones de distintos sacerdotes a la convocatoria a los ejercicios espirituales de 1894 (fs. 37-69); listas de confirmaciones y matrimonios y expedientes matrimoniales de Boruca, Térraba, El General y Buenos Aires realizados con ocasión de la visita pastoral de Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, a esos lugares en mayo de 1892 (fs. 119-160); informe del presbítero José Badilla al obispo, Mons. Thiel, sobre su vista a los pueblos de Boruca, Térraba, Buenos Aires, El General y caseríos de la costa del Pacífico realizada en 1894, junto con las listas de bautismos y matrimonios celebrados en El General, expedientes matrimoniales de Santa María de Dota y el acta de un matrimonio celebrado en Savegre (fs. 187-200); y solicitudes de capellanías por parte de personas particulares.

Correspondencia, solicitudes y expedientes tramitados en la Curia diocesana a lo largo del año 1895 sobre diversos asuntos.

Cabe destacar las denuncias presentadas por Henry Pittier contra Monseñor Juan Pablo Salazar por su actuación como sacerdote en San Francisco de Guadalupe (folios 2-7), demandas de esponsales y otros asuntos de tipo matrimonial, solicitudes de vecinos, el compromiso de los vecinos de Térraba, Boruca y Santo Domingo de Golfo Dulce de construir el templo y realizar otras obras de mejoramiento de sus respectivas localidades (fs. 140-147), las letras dimisorias a favor del presbítero Francisco Gutiérrez y el expediente de órdenes sacerdotales del presbítero Andrés Vilá y Albó, que incluye una certificación de 1904 de documentos académicos presentados por dicho Vilá (223-249).

Contiene expedientes y solicitudes dirigidas a la Curia diocesana sobre variados asuntos.

Incluye informaciones sobre la conducta de distintos sacerdotes, el inventario de bienes de la ermita de San Juan de Turrialba correspondiente a 1899 (folio 15), una cuestión de límites entre las parroquias del Carmen de San José y Curridabat dirimida en la Curia diocesana (fs. 22-25), un proceso por matrimonio clandestino (fs. 48-55), los inventarios de los templos de Buenos Aires, Térraba y Boruca (fs. 142-150), una información sobre la aparición de imágenes en el Cerro Colorado de Sabana Grande, Parroquia de Nicoya (1896, 178-181), distintos documentos relacionados con la visita pastoral de Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II obispo de San José, de 1898-1899 (fs. 188-202) y un expediente matrimonial de 1866 (fol. 266).

Contiene además documentos dejados por el difunto presbítero Domingo Rivas (fs. 223-328): Borradores referentes al presbítero Ramón Isidro Cabezas, a la construcción de la catedral y correspondencia recibida por el presbítero Rivas, entre otros.

Contiene circulares de Luis Hidalgo, prosecretario de la Vicaría Capitular durante el periodo de la primera Sede Vacante, con temas como: prohibición de sacar fuera de su archivo la documentación parroquial, exhortación para que los curas comuniquen a sus feligreses que deben participar en el censo de población, importancia de fomentar el sacramento del Matrimonio entre las personas que vivan en concubinato, nombramiento de Luis Hidalgo como párroco de Boruca y de Cipriano Fuentes como secretario del Gobierno Eclesiástico durante la ausencia de aquel.