Contiene documentos de diversa índole. Abundan las escrituras relativas a capellanías y cofradías, especialmente a la Cofradía de la Concepción del Viejo de Nicoya.

Contiene asimismo un Padrón General de la Reducción de la Inmaculada Concepción de Boruca (1802-10-13) y copia de un expediente relativo a la construcción de la Casa de Santo Tomás en San José (1815-12-19. San José / 1816-01-17. San José).

Cuentas de cargo y data de la Parroquia de Cartago dadas por sus distintos mayordomos, que comprenden los años 1773 a 1853.

Incluye además correspondencia recibida por el Mayordomo y por la Parroquia, el inventario de bienes del convento de la reducción de Orosi (año 1834, fols. 221 a 225), el inventario de bienes de la Iglesia Parroquial de Cartago (sin fecha, pero de tiempo del mayordomo Juan de Jesús Urrutia, que ocupó el cargo al menos entre 1824 y 1837; folios 271 y 272), concesiones del hábito del Carmen del año 1845 (folios 389 a 392) y del año 1859 (fol. 396) y unas relaciones estadísticas de los matrimonios, nacimientos y fallecimientos de los pueblos de Orosi, Turrialba y Tucurrique, correspondientes al año 1859, y de Nuestra Señora de Concepción de Boruca correspondiente al año 1899 (folios 397 a 400).

Contiene investigaciones canónicas sobre la actuación de distintos sacerdotes en sus parroquias, solicitudes de párrocos, solicitudes de vecinos de diversas poblaciones del país, asuntos matrimoniales, la investigación de un matrimonio clandestino (1898, expediente 40), legitimaciones de hijos y otros asuntos.

Cabe destacar los siguientes expedientes y asuntos tratados:

• Tercera Orden de Nuestra Señora del Carmen: Actas de la Tercera Orden de San José (1863, expediente 5) y memorial de la de Heredia (1898, expediente 17).
• Contribuciones vecinales para pagar un coadjutor en San Pablo de Heredia (1896, expediente 6) y en Sarchí (1898, expediente 26).
• Edificación de la Iglesia de La Merced de San José: Función benéfica en el Teatro Nacional (1898, expediente 9), certificación de resolución de la junta edificadora (1898, expediente 56).
• Junta edificadora del templo parroquial de Heredia (1898, expediente 10).
• Solicitud de los vecinos de San Pablo de Puriscal, parroquia de San Mateo, de agregación a la parroquia de Santiago de Puriscal (1898, expediente 14).
• Solicitud de erección de parroquia por los vecinos de Zapote (1898, expediente 18) y por los vecinos de San Ignacio de la Candelaria (1898, expediente 52). Este último expediente incluye listas de vecinos de las poblaciones aledañas y un informe del producto de primicias de la Parroquia de Aserrí.
• Erección de la parroquia de San Joaquín de Heredia (expediente 19).
• Petición de la Sociedad de Señoras de San Vicente de Paul en Guadalupe (1898, expediente 21); solicitud de la misma sociedad en Cañas (1898, expediente 49).
• Queja de los vecinos de Buenos Aires, Boruca y Térraba por la conducta del cura José Victoriano Mayorga y su disputa con Henry Pittier (1898, expedientes 22 y 23).
• Solicitud de los vecinos de Aserrí de conservar su párroco José G. Añibarro. Incluye lista de vecinos (1898, expediente 29).
• Solicitud de los vecinos de San Pedro de la Unión, jurisdicción de Grecia, para ser agregados a la coadjutoría de Sarchí (1898, expediente 34).
• Junta edificadora de Guadalupe (1898, expediente 35).
• Incorporación a la diócesis de San José de Costa Rica, para continuar sus estudios sacerdotales, de los presbíteros Francisco Göke (1896-1898, expediente 38) y Luis Leipold (1895-1898, expediente 39). Ambos expedientes incluyen cartas de presentación de Pedro Schumacher, obispo de Portoviejo, así como el curriculum vitae de Francisco Göke.
• Expedientes matrimoniales de Leopoldo Amador y Rosa Escalante Orias (1898, expediente 42) y de Leopoldo Solano y María Valenciano (1898, expediente 44).
• Solicitud de los vecinos de Santo Domingo de Heredia para que se les deje al coadjutor Juan Vicente Quirós (1898, expediente 46).
• Nombramiento de junta edificadora de la ermita del distrito de San Pedro, en Santa Bárbara de Heredia (1898, expediente 47).
• Expediente sobre el traslado de la imagen de Nuestra Señora de la Soledad de la Catedral de San José al templo de la Soledad (1898, expediente 55).

Contiene expedientes matrimoniales enviados por las parroquias de la diócesis a la Curia eclesiástica para su resolución, correspondencia de la curia con parroquias, autoridades civiles y particulares, junto con juicios de divorcio y otros documentos.

Cabe destacar los inventarios de bienes y archivos de las iglesias de Tucurrique y Turrialba (fs. 88-89) y de la Parroquia de Santa Cruz de Guanacaste (fs. 281-283), dos juicios de esponsales (fs. 105-140 y 384-396) y un juicio de nulidad (fs. 262-268), informe de la Parroquia de La Unión sobre matrimonios separados (fs. 151-152) y asientos de matrimonios efectuados en el pueblo de Terbi (Golfo Dulce) por el Cura interino de Boruca, Rafael B. Chinchilla entre el 20 de julio y el 10 de agosto de 1870 (fs. 275-276).

Predomina 1870.

Contiene documentación muy variada referente a los episcopados de Mons. Bernardo Augusto Thiel y Juan Gaspar Stork, segundo y tercer obispos de San José respectivamente, destacando:

• Borrador de alocución dirigida al clero el primer día del sínodo diocesano (fs. 1-15), más un decreto de Mons. Thiel relativo al mismo ("Modus vivendi", fol. 16).

• Planos, cotizaciones, facturas, cuentas, correspondencia relativos a la construcción de diversos templos y edificios de la diócesis de San José, especialmente el antiguo palacio episcopal, la catedral de San José y el templo de Limón (fs. 17 a 52).

• Expediente matrimonial de Boruca del año 1907 (fs. 55A-56).

• Consideraciones históricas firmadas por Manuel J. Jiménez, relativas a la aparición de la Virgen de los Ángeles (incompleto, fs. 58-59).

• Estadísticas de población de Costa Rica a 31 de diciembre de 1904 según la Dirección General de Estadística (fs. 60-75).

• Cuentas de la herencia del presbítero Raimundo Mora (fs. 87-103).

• Anotaciones relativas al Código de Derecho Canónico de 1917 (fs. 113-144).

Correspondencia de parroquias dirigida a Mons. Bernardo A. Thiel, II Obispo de San José, y a la curia diocesana, correspondiente a los meses de enero a junio de 1881, ordenada cronológicamente por meses, relativa a nombramientos, administración parroquial, tramitación de matrimonios y otros asuntos.

Incluye además alguna carta de autoridades civiles y particulares.

Cabe destacar las referencias a las visitas pastorales de Thiel, así como de algunos sacerdotes a Térraba y Boruca (fs. 5-6 y 31-32) y a Sarapiquí (fs. 23 y 234), a la construcción de la iglesia de Limón (fs. 110 y 216), a la publicación "El Correo Español" (fs. 169-170 y 227) y a la ermita de San Francisco de Asís en Guadalupe (fol. 308) y el informe sobre los límites entre las parroquias de San Vicente de Moravia y San Isidro de Coronado (fol. 273).

Incluye además copia del testamento de Maurilio Alvarado y carta de Marie Barthélemy de Sión a Mons. Thiel (fs. 206-207).

Contiene la correspondencia relativa a las misiones efectuadas por Jodoco Krautwig, religioso de la Congregación de la Misión, en Guanacaste, Puntarenas y otras partes del país, así como la correspondencia de Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, y otros miembros de la Curia diocesana con autoridades locales de Talamanca, Térraba y Boruca, junto con cuentas y otros documentos relacionados con dichas misiones.

La correspondencia está organizada por regiones y dentro de cada una de ellas cronológicamente, de la siguiente forma:

1. Misiones de Jodoco Krautwig en los años 1883 y 1884 (folios 1-193);
2. Talamanca, 1881-1883 (fs. 194-330);
3. Chirripó, 1883 (fs. 331-333);
4. Talamanca, 1884 (fs. 334-346);
5. Boruca, 1881-1884 (fs. 347-399);
6. Térraba, 1881-1884 (fs. 400-420).

Cabe destacar, dentro de los documentos de las misiones realizadas por Jodoco Krautwig en 1884, distintas oraciones y leyendas, especialmente varias versiones de la oración a la Virgen de Monserrate (fs. 146-153), así como fragmentos del diario del religioso relativos a su paso en 1884 por Escazú, Santa Ana, Ciudad Colón, Puriscal y Tortuguero (fs. 154-155 y 188-189); y una carta de Próspero Fernández, presidente de la República, a Thiel, sobre la evangelización del indio Emeterio por el obispo (1883, fol. 217).

Incluye al final un índice de la correspondencia (fs. 421-422).

Contiene expedientes matrimoniales aprobados por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, con ocasión de sus visitas pastorales a diversas zonas del país en los años 1881 y 1882, concretamente a Portalón (folios 57-62), Cahuita (fol. 63), Juan Viñas (fs. 97-103), Tabarcia (fs. 104-105) y a diferentes puntos de la parroquia de Aserrí (fs. 186-196), así como remitidos a Monseñor Thiel para su aprobación durante su destierro en Panamá (fs. 197-204, 215-221, 223-234, 249-258 y 277-278).

Contiene además documentos muy diversos, en general relacionados con las visitas pastorales de Monseñor Thiel (nota sobre matrimonio celebrado por Monseñor Thiel en Portalón y notas de su visita a Boruca en 1881, fs. 64-65; información de diciembre de ese mismo año levantada por el canónigo Francisco Calvo sobre la difusión de ideas irreligiosas por el maestro de escuela de Aserrí, fs. 89-96; bautismos y matrimonios celebrados en Talamanca en 1882, fs. 106-109; borrador de carta de Mons. Thiel al gobernador de Limón sobre su visita pastoral a La Estrella en 1882, fs. 110-111; borrador incompleto de una crónica de una visita pastoral a Limón y Talamanca, fs. 114-119; e informe del estado moral y material de la Parroquia de Heredia junto con los inventarios de bienes y archivo de la parroquia y filiales con ocasión de su visita en 1882, fs. 124-179 ) o remitida al mismo durante su estancia en Panamá (solicitudes diversas, absoluciones de sacerdotes, letras dimisorias de Juan Trejos para su ordenación sacerdotal, fs. 247-248, y especialmente la información levantada por Monseñor Thiel en los meses de julio y agosto de 1885 relativa a la expulsión de los religiosos de la Congregación de la Misión que regentaban el Seminario de San José, fs. 1-39, y el expediente promovido por Monseñor Thiel en 1885 por indicación de la Santa Sede para la provisión de la sede arzobispal de Guatemala en fs. 236-245).

Contiene además algunos documentos anteriores al episcopado de Monseñor Thiel, especialmente una copia de las actas de la visita pastoral realizada en 1872 a Cartago y diversos lugares de la provincia (fs. 120-123).

Correspondencia recibida por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, durante el año 1888, procedente principalmente de particulares y grupos de vecinos, más algunas cartas remitidas por autoridades locales de Talamanca y Boruca y por la Sociedad de San Vicente de Paul. Excepcionalmente algunas cartas están dirigidas a Antonio del Carmen Zamora, Vicario General de la diócesis.

Cabe destacar la correspondencia escrita desde Talamanca por Juan H. Lyon y la escrita por José S. Sequeira informando al obispo de la marcha de las obras en la Catedral, palacio episcopal y seminario (folios 234-235, 244, 306-307).

Incluye además borradores de las respuestas de Thiel, las condiciones de la matrícula en el Seminario Menor (fol. 4), cuentas de entradas y salidas (fs. 14-20 y 326-328) y una copia de la oración hallada en el Santo Sepulcro remitida a Thiel por una feligrés (fs. 208-210).

La correspondencia está ordenada cronológicamente excepto los últimos folios.

Contiene documentos de diversa índole, especialmente:

• Inventarios de bienes y en ocasiones de archivos de distintas parroquias de la diócesis de San José de los años 1888, 1891 y 1892 (folios 1-30, 66-71 y 109-113);
• Correspondencia recibida por por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, y por sus colaboradores de la Curia diocesana durante el año 1891;
• Dispensas y expedientes matrimoniales tramitados en la Curia diocesana durante 1890 y 1891;
• Expedientes de solicitudes diversas dirigidas a la Curia;
• Confirmaciones hechas en Limón el 22 de septiembre de 1882 (fs. 188-189);
  -Contrato de compraventa entre Luis Machado, natural de china, y el presbítero José Victoriano Mayorga de un solar en Matina (1888, fol. 190);
• Bautismos, matrimonios y expedientes matrimoniales realizados en 1888 en la comarca de Limón por el presbítero José Victoriano Mayorga (fs. 191-210);
• Informe de la visita practicada en la Parroquia de Bagaces por el presbítero Januario Quesada en 1888, junto con un inventario de la parroquia y tres expedientes matrimoniales (fs. 211-225);
• Informe de la misión realizada a la comarca de Limón en 1888 (fs. 226-227);
• Listas de imposiciones de escapularios y expedientes matrimoniales de Golfo Dulce (1890, fs. 228-240);
• Informe de la visita realizada a Boruca, Térraba, Buenos Aires, Golfo Dulce y Savegre por el presbítero José Badilla en 1891, junto con bautismos, matrimonios, defunciones, expedientes matrimoniales e informaciones de cristiandad y defunción de esos lugares (fs. 241-284);
• Expedientes de legitimación de hijos (1891, fs. 286-291);
• Solicitudes de Juan de Dios Ortiz, juez de paz de San Francisco de Térraba (1891, fs. 292-295);
• Acta de la junta edificadora de la iglesia de Golfo Dulce (fs. 298-300).