El Centro Nacional de Catequesis (CENACAT) es un organismo de la Conferencia Episcopal de Costa Rica creado en el año 2008. Tuvo su primera sede en las instalaciones de los padres franciscanos de San Antonio de Guadalupe. En diciembre de 2019 se trasladó a la sede de la Conferencia Episcopal.
El Eco Católico fue fundado por Mons. Thiel. Su primer número se publicó el 6 de enero de 1883, dando comienzo entonces a una primera etapa que, con interrupciones, llegó hasta el año 1903. Concretamente, su publicación estuvo suspendida de julio de 1884 a julio de 1889 y octubre de 1893 a enero de 1898. El Eco Católico nació y su mantuvo durante el periodo 1883-1903 como un periódico católico de marcado carácter polemista y combativo, de defensa contra la ideología liberal entonces en boga y contra los ataques que la Iglesia recibía de ésta. Durante ese primer periodo tuvo una periodicidad semanal, al igual que ahora.
El 3 de mayo de 1931 se inició una nueva etapa del Eco Católico y desde esa fecha la revista se ha publicado de forma ininterrumpida hasta el día de hoy. Este nuevo Eco Católico es ahora un medio de difusión de la doctrina católica, sin el tono beligerante de la primera etapa. En este periodo han sido directores del semanario los sacerdotes Carlos Borge Castrillo, Víctor Manuel Arrieta, Armando Alfaro y Glenn Gómez. Su actual director es Martín Rodríguez González. En 2007 pasó a ser administrado por la conferencia Episcopal de Costa Rica.
La Conferencia Episcopal de Costa Rica (CECOR) es una institución de carácter permanente, constituida por los Obispos del país, con la aprobación de la Santa Sede, para estudiar y resolver conjuntamente los problemas eclesiales de interés común.
Las conferencias episcopales a nivel internarional tienen sus orígenes remotos en el siglo XIX, pero no fueron reguladas por el Derecho Canónico hasta el Concilio Vaticano II, de modo que hasta entonces funcionaron como una realidad de hecho existente en algunos países.
En el caso de Costa Rica, los obispos tuvieron que coordinar sus actuaciones desde la constitución de la Provincia Eclesiástica en 1921 y lo hicieron suscribiendo conjuntamente cartas pastorales y circulares dirigidas a los fieles de todo el país. Asimismo, los obispos costarricenses establecieron la práctica de la Conferencia Episcopal desde 1934, siendo arzobispo Rafael Otón Castro, y continuaron manteniendo ese tipo de reuniones durante los episcopados siguientes, pero sin contar con estatutos. El 22 de junio de 1964 la Santa Sede aprobó los primeros estatutos de la Conferencia Episcopal de Costa Rica, quedando compuesta la Conferencia por una Asamblea Plenaria y un Comité Permanente.
La Conferencia Episcopal de Costa Rica estuvo presidida por el Arzobispo de San José hasta el año 1970, pues a finales de ese año Román Arrieta Villalobos, entonces obispo de Tilarán, asumió la presidencia de la CECOR. No tuvo sede fija y se reunió en distintos lugares, hasta la inauguración del actual edificio de la CECOR en Calle 20.
La erección del seminario de la Diócesis de San José era una obligación establecida en la propia bula de creación de la diócesis y su primer obispo, Anselmo Llorente y Lafuente, procuró hacerlo realidad desde los inicios de su episcopado. Su construcción se inició en 1854 según planos de Francisco Kurtze y concluyó 14 años después, aunque las clases iniciaron en 1863, antes por tanto de que hubieran terminado las obras. El primer rector del seminario fue el guatemalteco Martín Mérida, sustituido en 1870 por José Zamora. Esta primera etapa del seminario concluyó con su cierre el 31 de diciembre de 1872.
El 3 de enero de 1878 abrió nuevamente el seminario, esta vez regentado por religiosos de la Congregación de la Misión (más conocidos como lazaristas o paulinos), concretamente: Juan Bautista Theilloud, Tomás Gougnon y Bernardo Augusto Thiel. En esos años recibió el nombre de "Seminario de la Inmaculada Concepción".
La expulsión del país de los lazaristas en julio de 1885 hizo que el seminario volviera a ser administrado por el clero diocesano hasta 1893. En esta etapa fueron rectores los sacerdotes Carlos María Ulloa (1885-1886), Guillermo Rojas Arrieta (1886-1887), Carlos Francisco Gey (1887-1892) y Luis Hidalgo (1892-1893).
El 29 de junio de 1893 llegaron a Costa Rica 14 lazaristas alemanes, encabezados por Juan Gaspar Stork, para hacerse cargo del seminario, labor que desempeñaron hasta 1966, cuando la congregación comunicó que no podía seguir administrando el seminario.
En el periodo 1893-1966, colaboraron en el seminario sacerdotes de gran capacidad intelectual y espiritual, como Agustín Blessing, Carlos Trapp, Juan Odendahl, José Ohlemüller, Juan Koch, José Pauels... En estos años se fueron creando en el seno del seminario diversos grupos de formación académica que en 1927 integraron la Congregación Mariana del Seminario Mayor. Los temblores sucedidos en marzo de 1924 obligaron a la reedificación del seminario entre 1924 y 1925.
El 27 de abril de 1936, el decreto de la Sagrada Congregación de Seminarios y Universidades Católicas dio al seminario de San José la categoría de Central para las Arquidiócesis de San José y de Panamá, la Diócesis de Alajuela y los vicariatos apostólicos de Limón y Darién. No obstante, el 18 de noviembre de 1938 la Santa Sede decidió que el Seminario Central de San José se constituyera en seminario interdiocesano, exclusivo para la formación del clero de la Provincia Eclesiástica de Costa Rica.
Monseñor Sanabria, desde el inicio de su episcopado como arzobispo de San José, promovió la construcción de un nuevo edificio capaz de alojar un seminario para toda la provincia eclesiástica. En 1946 se iniciaron los trabajos del nuevo seminario en Paso Ancho (San José), que finalmente se inauguró en 1950.
Durante todos estos años dentro del seminario funcionó un colegio seminario, que admitía a estudiantes externos, hasta la fundación del Seminario Menor, que tuvo lugar igualmente en el año 1950.
A raíz de la marcha de la Congregación de la Misión en 1966, la Conferencia Episcopal de Costa Rica decidió darle a la casa de formación el nombre de Seminario Nacional, que quedó bajo la responsabilidad de sacerdotes procedentes de las distintas diócesis del país. Desde 1971 colaboran en el seminario profesores laicos.
El Seminario Menor Nuestra Señora de los Ángeles fue erigido por el arzobispo de San José Mons. Víctor Sanabria Martínez mediante decreto arzobispal de 4 de febrero de 1950, iniciando su actividad el 19 de marzo de ese año con 44 alumnos. Su primer rector fue el pbro. Rubén Odio Herrera, nombrado en 1952 III arzobispo de San José. Le sucedieron en esa responsabilidad los sacerdotes Óscar José Trejos, Francisco Herrera, Carlos Gálvez, Ignacio Trejos, Manuel Galloso, Jorge Quirós, Luis Guillermo Calderón y Walter Sandí.
En 1954 el Seminario Menor fue trasladado al distrito de San Rafael de Tres Ríos, donde funcionó hasta 1978. El 27 de noviembre de ese año fue clausurado por Mons. Enrique Bolaños, obispo de Alajuela y en ese momento administrador apostólico de la Arquidiócesis de San José.
Durante sus 29 años de vigencia, estudiaron en el Seminario Menor más de 3 180 alumnos.
El Instituto Teológico de América Central Intercongregacional (ITAC), es un centro de formación, reflexión e investigación teológica que tiene su sede en San Pedro de Montes de Oca.
Nacido en 1972 bajo los auspicios de la Conferencia Episcopal y la Conferencia de Religiosos y Religiosas de Costa Rica, durante sus primeros seis años fue la institución donde se formaron conjuntamente los candidatos al sacerdocio y a la vida religiosa y otros agentes de pastoral. Desde 1979 es administrado por órdenes religiosas.
La Escuela Social Juan XXIII es una institución de la Iglesia Católica, creada en 1963 para enseñar, difundir y promover la aplicación de la Doctrina Social de la Iglesia en la sociedad costarricense.
Dirigente de la Unión Soviética.